Les systèmes d'assainissement des eaux usées intégrés utilisent souvent des méthodes de traitement naturelles telles que la phytoépuration, les zones humides construites, les filtres verts et les lagunages naturels. Ces approches utilisent des plantes, des micro-organismes et des processus biologiques pour décomposer et éliminer les contaminants des eaux usées, tout en favorisant la régénération des sols et la restauration des écosystèmes.
 

En traitant les eaux usées de manière à les réintroduire dans les sols et les écosystèmes environnants, l'assainissement intégré aide à protéger les ressources en eau douce en réduisant la pollution des eaux de surface et souterraines. Cela contribue à préserver la qualité de l'eau et à protéger la biodiversité des écosystèmes aquatiques.